משרד הפנים אחראי על שני עולמות שירות עיקריים. הראשון, ובו רוב הפניות של הציבור, מנוהל על ידי רשות האוכלוסין וההגירה — זרוע הביצוע שמנפיקה תעודות זהות ודרכונים ביומטריים, מנהלת את מרשם האוכלוסין, האזרחות, מעמד זרים, אשרות, ביקורת גבולות ואכיפה, דרך לשכות מינהל אוכלוסין בפריסה ארצית. המוקד הארצי שלה הוא *3450, וקבלת הקהל בלשכות היא בזימון תור מראש.
העולם השני הוא המשרד עצמו, שעוסק בשלטון מקומי — בחירות ברשויות המקומיות, רישוי עסקים, ארנונה, חוקי עזר, סיוע לרשויות בשעת חירום, עדות דתיות, חופי רחצה, המעבר לשעון קיץ/חורף וניהול המאגר הביומטרי הלאומי. יחידות המשרד כוללות את המינהל לשלטון מקומי, מינהל הפיתוח, המינהל לשירותי חירום, היחידה הארצית לפיקוח על הבחירות והאגף לעדות דתיות. מטה המשרד ברחוב קפלן 2, ירושלים; מנכ"ל המשרד הוא ישראל אוזן. פניות כלליות למשרד — דרך המוקד הממשלתי 1299 או טופס פניות הציבור.
